Διερεύνηση λυμάτων για την παρουσία ιών
| datacite.contributor.RelatedPerson | Μιχάλης Λεοτσινίδης | |
| datacite.contributor.RelatedPerson | Φεβρονία Κολονίτσιου | |
| datacite.contributor.Supervisor | Απόστολος Βανταράκης | |
| dc.contributor.author | Φωκάς, Ραφαήλ | |
| dc.contributor.other | Fokas, Rafail | |
| dc.date.accessioned | 2023-11-14T09:49:09Z | |
| dc.date.available | 2023-11-14T09:49:09Z | |
| dc.date.issued | 2023-10-26 | |
| dc.degree | masterThesis | |
| dc.description.abstract | Πολύ συχνά, στα λύματα ανιχνεύονται ιοί ανθρώπινης προέλευσης, οι οποίοι είναι δυνητικά παθογόνοι και επικίνδυνοι για τη Δημόσια Υγεία. Δύο από τους πιο σημαντικούς ιούς είναι ο αδενοϊός και ο ιός της ηπατίτιδας Α. Οι αδενοϊοί αποτελούν ιικούς δείκτες μόλυνσης και ευθύνονται για σοβαρά γαστρεντερικά και αναπνευστικά προβλήματα υγείας. Την ίδια στιγμή ο ιός της ηπατίτιδάς Α είναι η κύρια αιτία οξείας ηπατίτιδας στον άνθρωπο και κατατάσσεται στα σημαντικότερα τροφιμογενή παθογόνα. Η παρούσα διπλωματική είχε ως στόχο να διερευνήσει την παρουσία αδενοϊού και ιού της ηπατίτιδας Α σε δείγματα αστικών λυμάτων του βιολογικού καθαρισμού της Πάτρας. Κάθε εβδομάδα λαμβάνονταν από τη Δημοτική Επιχείρηση Ύδρευσης και Αποχέτευσης Πάτρας (ΔΕΥΑΠ) τρία 24ώρα δείγματα, τις τρεις πρώτες ημέρες κάθε εβδομάδας. Η δειγματοληψία πραγματοποιούνταν από την είσοδο του βιολογικού καθαρισμού για διάστημα 6 μηνών, σύμφωνα με τις κατευθυντήριες οδηγίες του Εθνικού Οργανισμού Δημόσιας Υγείας (ΕΟΔΥ). Μετά τη συλλογή ακολουθούσε εξαγωγή του νουκλεϊκού οξέος και στη συνέχεια ποσοτική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης σε πραγματικό χρόνο (RT-qPCR) για την ανίχνευση και την ποσοτικοποίηση των ιών (γονιδιακά αντίγραφα/λίτρο). Τα αποτελέσματα της παρούσας μελέτης ανέδειξαν ένα εντυπωσιακό ποσοστό θετικότητας του αδενοϊού, αγγίζοντας το 94,2%, ενώ η ηπατίτιδα Α αποδείχθηκε ολικά αρνητική. Ακολούθησε στατιστική συσχέτιση μεταξύ των γονιδιακών αντιγράφων και εννέα χημικών παραμέτρων των λυμάτων. Από τις συσχετίσεις μια αποδείχθηκε στατιστικώς σημαντική. Συμπερασματικά, η επικράτηση του θετικού αποτελέσματος για τον αδενοϊό κατά τη διάρκεια ολόκληρου του εξαμήνου και η σταθερή παρουσία του αποτελεί αντίκρισμα της βιβλιογραφίας. Αυτή επιβεβαιώνει ότι ο αδενοϊός παραμένει ανθεκτικός και διατηρεί σταθερή απόκριση στο περιβάλλον για εκτεταμένα χρονικά διαστήματα μετά τη νόσηση, χωρίς να παρουσιάζει εποχικό μοτίβο. Η απουσία της ηπατίτιδας Α στα δείγματα λυμάτων συνάδει με τα κλινικά δεδομένα της περιόδου. | |
| dc.description.translatedabstract | Very often, viruses of human origin are detected in wastewater, which are potentially pathogenic and dangerous for Public Health. Two of the most important viruses are adenovirus and hepatitis A virus. Adenoviruses are viral markers of infection and are responsible for serious gastrointestinal and respiratory health problems. At the same time, the hepatitis A virus is the main cause of acute hepatitis in humans and ranks among the most important foodborne pathogens. The aim of this dissertation was to investigate the presence of adenovirus and hepatitis A virus in municipal wastewater samples from the biological purification of Patras. Every week, three 24-hour samples were taken by the Municipal Water Supply and Sewerage Company of Patras (DEYAP), on the first three days of each week. The sampling was carried out from the entrance of the biological treatment for a period of 6 months, according to the guidelines of the National Public Health Organization (EODY). The collection was followed by nucleic acid extraction and then quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) to detect and quantify viruses (genome copies/liter). The results of the present study showed an impressive positivity rate for adenovirus, reaching 94.2%, while hepatitis A was completely negative. A statistical correlation between the gene copies and nine chemical parameters of the wastewater followed. Of the correlations, one proved to be statistically significant. In conclusion, the prevalence of the positive result for adenovirus during the entire semester and its constant presence reflects the literature. This confirms that the adenovirus remains resistant and maintains a stable response to the environment for extended periods of time after infection, showing no seasonal pattern. The absence of hepatitis A in the sewage samples is consistent with the clinical data of the period. | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/10889/26221 | |
| dc.language.iso | el | |
| dc.subject | Αστικά λύματα | |
| dc.subject | Επιδημιολογία λυμάτων | |
| dc.subject | Ιοί | |
| dc.subject | Μοριακή ανίχνευση | |
| dc.subject.alternative | Municipal wastewater | |
| dc.subject.alternative | Wastewater epidemiology | |
| dc.subject.alternative | Viruses | |
| dc.subject.alternative | Molecular detection | |
| dc.title | Διερεύνηση λυμάτων για την παρουσία ιών | |
| dc.title.alternative | Investigation of wastewater for the presence of viruses |