Τα επίπεδα μεθυλίωσης και έκφρασης μακρών μη κωδικών μορίων RNA στον μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα
Loading...
Date
2024-06-21
Authors
Χρόνη, Αργυρή
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Ο καρκίνος του πνεύμονα χαρακτηρίζεται από τον ανεξέλεγκτο πολλαπλασιασμό των κυττάρων στους ιστούς του πνεύμονα και είναι ένας από τους πιο συχνούς και θανατηφόρους τύπους καρκίνου. Διακρίνεται σε δύο κύριους ιστολογικούς τύπους, τον μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα και τον μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα, ο οποίος αποτελεί και τον πιο κοινό τύπο. Ο μη μικροκυτταρικός καρκίνος διακρίνεται περαιτέρω σε τρεις υποτύπους, το αδενοκαρκίνωμα, το ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα και το μεγαλοκυτταρικό καρκίνωμα. Ο καρκίνος είναι αποτέλεσμα του συνδυασμού γενετικών μεταλλάξεων, επιγενετικών τροποποιήσεων και περιβαλλοντικών παραγόντων. Οι επιγενετικές τροποποιήσεις εμφανίζονται με μεγάλη συχνότητα στον καρκίνο του πνεύμονα, και περιλαμβάνουν την μεθυλίωση του DNA, τις τροποποιήσεις των ιστονών και την έκφραση των μη κωδικών μορίων RNA, μηχανισμοί που επηρεάζουν την έκφραση των γονιδίων χωρίς να αλλάζουν την αλληλουχία του DNA, και έχουν σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη και την εξέλιξη του μη μικροκυτταρικού καρκίνου του πνεύμονα. H αυξημένη μεθυλίωση που παρατηρείται στους υποκινητές των ογκοκατασταλτικών γονιδίων και οι τροποποιήσεις των ιστονών που προκαλούν αλλαγές στην δομή της χρωματίνης, επηρεάζουν την έκφραση γονιδίων που εμπλέκονται στην καρκινογένεση, ενώ τα μη κωδικά μόρια RNAs, όπως τα lncRNAs, έχουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης και στην ανάπτυξη του καρκίνου και παρουσιάζουν, πολλές φορές, διαφοροποιημένη έκφραση μεταξύ φυσιολογικών και καρκινικών κυττάρων.
Ο παράγοντας που σχετίζεται με το λέμφωμα/λευχαιμία (LRF, Leukemia/lymphoma related factor) είναι ένας επιγενετικός παράγοντας, ο οποίος δεσμεύεται σε ρυθμιστικές περιοχές του DNA και δρα μαζί με άλλους παράγοντες, λόγω της χαρακτηριστικής δομής που έχει, ενώ μπορεί να ασκήσει ρυθμιστική δράση σε γονιδιακούς τόπους και μη κωδικών μορίων RNA, εκτός από γονίδια που κωδικοποιούν πρωτεΐνες.
Σκοπός της συγκεκριμένης εργασίας είναι η αξιολόγηση και η κατανόηση των διαφορών που υπάρχουν μεταξύ των υποτύπων του μη μικροκυτταρικού καρκίνου του πνεύμονα, που έχουν την μετάλλαξη KRAS, όσον αφορά την μεθυλίωση και την έκφραση μακρών μη κωδικών μορίων RNA (lncRNAs) και η συσχέτιση (σε δεύτερο επίπεδο) με την έκφραση του μεταγραφικού παράγοντα LRF/ZBTB7A. Στα πλαίσια της μελέτης αυτής πραγματοποιήθηκε σύγκριση μεταξύ δύο καρκινικών κυτταρικών σειρών, την Α549, που είναι αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα και την Η460, που είναι μεγαλοκυτταρικό καρκίνωμα πνεύμονα, με μία φυσιολογική κυτταρική σειρά επιθηλιακών κυττάρων πνεύμονα, την BEAS-2B, Η παρούσα εργασία επικεντρώνεται στη διερεύνηση των επιπέδων μεθυλίωσης και της έκφρασης των lncRNAs MALAT1, PVT1, DANCR, HOTAIRM1, MEG3 και H19 στις τρεις αυτές κυτταρικές σειρές που αξιολογήθηκαν, καθώς και των επιπέδων έκφρασης του μεταγραφικού παράγοντα LRF. Τέλος, αξιολογείται κατά πόσο η ρύθμιση της έκφρασης των συγκεκριμένων lncRNAs που μελετήθηκαν συσχετίζεται, σε κάποιο βαθμό, με την μεθυλίωσή τους αλλά και με την έκφραση του παράγοντα LRF.
Description
Keywords
Επιγενετική, Μη μικροκυτταρικός καρκίνος του πνεύμονα, Μακρά μη κωδικά μόρια RNA, Μεθυλίωση