Χρήση φασματοσκοπίας nmr και μοριακών γραφικών για την ταυτοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση βιοδραστικών πεπτιδίων του συστήματος τοξινών αντιτοξινών mqsr-mqsa
| dc.contributor.advisor | Βλάμης, Αλέξιος | |
| dc.contributor.author | Κουσίση, Μαρία | |
| dc.contributor.committee | Βλάμης, Αλέξιος | |
| dc.contributor.committee | Ζουμπουλάκης, Παναγιώτης | |
| dc.contributor.committee | Τσέλιος, Θεόδωρος | |
| dc.contributor.other | Kousisi, Maria | |
| dc.date.accessioned | 2020-10-08T10:22:38Z | |
| dc.date.available | 2020-10-08T10:22:38Z | |
| dc.date.copyright | 2019-07-12 | |
| dc.degree | Μεταπτυχιακή Εργασία | el |
| dc.description.abstract | Στην παρούσα Διπλωματική Εργασία πραγματοποιήθηκε διαμορφωτική ανάλυση δυνητικά βιοδραστικών πεπτιδίων (MqsR, MqsA1και MqsA2), του συστήματος τοξινών-αντιτοξινών MqsR-MqsA του βακτηρίου Escherichia coli. Η ανάλυση έγινε με συνδυαστική χρήση Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού (NMR) σε DMSO και Μοριακής Μοντελοποίησης. Από τα πειράματα NMR (1Η, TOCSY, NOESY, COSY και HSQC), πραγματοποιήθηκε αρχικά η διαμορφωτική μελέτη των συνθετικών πεπτιδίων MqsR, MqsA1και MqsA2. Στη συνέχεια, οι πιθανές διαμορφώσεις εξετάστηκαν με λογισμικά μοριακής μοντελοποίησης. Τέλος, έγινε σύγκριση των πιθανών διαμορφώσεων με τις αντίστοιχες δομές των πεπτιδίων στην κρυσταλλική τους δομή | el |
| dc.description.translatedabstract | A combination of NMR Spectroscopy and Molecular Modeling were used for the conformational analysis of potentially bioactive peptides from the MqsRMqsA toxin-antitoxin system of Escherichia coli. Firstly, NMR experiments (1Η, TOCSY, NOESY, COSY and HSQC) were performed in DMSO to obtain the structure of the composite biological analogs MqsR, MqsA1 and MqsA2. In a second step, structures were further processed by computational tools to explore their possible conformations. Comparisons of the obtained conformations with their respective structures in crystals showed marked differences for peptide MqsA1 (RMSDs around 8), while peptides MqsA2 and MqsR were more similar (RMSDs 3-4). | el |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10889/13955 | |
| dc.language.iso | gr | el |
| dc.rights | 12 | el |
| dc.subject | Φασματοσκοπία nmr | el |
| dc.subject | Διαμορφωτική μελέτη | el |
| dc.subject.alternative | Spectroscopy nmr | el |
| dc.subject.alternative | Conformational analysis | el |
| dc.title | Χρήση φασματοσκοπίας nmr και μοριακών γραφικών για την ταυτοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση βιοδραστικών πεπτιδίων του συστήματος τοξινών αντιτοξινών mqsr-mqsa | el |
| dc.title.alternative | Implementation of spectroscopy nmr and molecular graphics for identification and formulation bioactive peptides of toxin-antitoxin system mqsr-mqsa | el |
| dc.type | Thesis | el |