Απαλοιφή του γονιδίου του TCF-1 μέσω CRISPR/Cas9 γονιδιωματικής επεξεργασίας και διερεύνηση της επίδρασής του σε προφλεγμονώδεις κυτταροκίνες
| datacite.contributor.RelatedPerson | Σταθόπουλος, Κωνσταντίνος | |
| datacite.contributor.RelatedPerson | Θεοχάρης, Αχιλλέας | |
| dc.contributor.advisor | Βασιλόπουλος, Ιωάννης | |
| dc.contributor.author | Ασμενούδη, Πασχαλιά | |
| dc.contributor.other | Asmenoudi, Paschalia | |
| dc.date.accessioned | 2024-02-22T11:12:28Z | |
| dc.date.available | 2024-02-22T11:12:28Z | |
| dc.date.issued | 2024-02-19 | |
| dc.degree | masterThesis | |
| dc.description.abstract | Η ανάπτυξη των Τ κυττάρων και η απόφαση για την τελική γενεαλογία αποτελούν ιδιαίτερα σημαντικές και περίπλοκες διαδικασίες. Ένας πρωτοπόρος μεταγραφικός παράγοντας που εμπλέκεται δραστικά στον καθορισμό της μοίρας των Τ κυττάρων είναι ο TCF-1, ο οποίος κωδικοποιείται από το γονίδιο TCF7. Ο TCF-1, εκτός από την εμπλοκή του στην ανάπτυξη των Τ κυττάρων, διαθέτει ποικίλους ρόλους, καθώς φαίνεται να συμμετέχει στο μονοπάτι Wnt και στην αναδιαμόρφωση της χρωματίνης. Στην παρούσα διπλωματική εργασία, επιδιώκοντας να αναδείξουμε τη σπουδαιότητα του TCF-1, σκοπός είναι η αποσιώπηση του TCF7 σε Τ λευχαιμικά κύτταρα (JURKAT), αξιοποιώντας το σύστημα γονιδιωματικής επεξεργασίας CRISPR/Cas9. Για τον σκοπό αυτό σχεδιάστηκαν με τη βοήθεια βιοπληροφορικών εργαλείων δύο μόρια single guide RNA (sgRNA), τα οποία στοχεύουν το συγκεκριμένο γονίδιο. Τα κύτταρα που επέζησαν μετά την επιλογή κλώνων αφορούσαν το δεύτερο μόριο, από τα οποία τελικά εστάλη για αλληλούχηση μόνο ένας κλώνος. Τα αποτελέσματα της αλληλούχησης υποδεικνύουν διαφορές στις βάσεις των τροποποιημένων κυττάρων, έναντι των φυσιολογικών, γεγονός αρκετά ενθαρρυντικό για τη θετική έκβαση του πειράματος. | |
| dc.description.translatedabstract | The development and lineage decision-making of T cells are complex and critical processes. TCF-1, a pioneering transcription factor encoded by the TCF7 gene, plays a significant role in T cell fate determination. Beyond its involvement in T cell development, TCF-1 participates in various roles, including the Wnt pathway and chromatin remodeling. This thesis aims to elucidate the significance of TCF-1 by silencing the TCF7 gene in T leukemic cells (JURKAT) using the CRISPR/Cas9 genome-editing system. Two single guide RNA (sgRNA) molecules targeting this gene were designed using bioinformatics tools. Post-clonal selection, cells surviving were from the second sgRNA, with only one clone being sent for sequencing. The sequencing results showed base differences in the modified cells compared to normal ones, which is quite encouraging for a successful experimental outcome. | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/10889/26594 | |
| dc.language.iso | el | |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ | * |
| dc.subject | Αποσιώπηση | |
| dc.subject.alternative | TCF-1 | |
| dc.subject.alternative | CRISPR/Cas9 | |
| dc.subject.alternative | JURKAT | |
| dc.subject.alternative | Knockout | |
| dc.title | Απαλοιφή του γονιδίου του TCF-1 μέσω CRISPR/Cas9 γονιδιωματικής επεξεργασίας και διερεύνηση της επίδρασής του σε προφλεγμονώδεις κυτταροκίνες | |
| dc.title.alternative | Deletion of the TCF-1 gene through CRISPR/Cas9 genomic editing and investigation of its effect on proinflammatory cytokines |