Μελέτη του μκροβιώματος του καλλιεργούμενου μυδιού (mytilus galloprovincialis) σε παράκτιες ζώνες της Ελλάδας χρησιμοποιώντας τεχνικές αλληλούχησης τρίτης γενιάς
Loading...
Date
2025-02-19
Authors
Αναστασιάδης, Στυλιανός
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Η παρούσα διπλωματική εργασία επικεντρώνεται στη μελέτη του μικροβιώματος του καλλιεργούμενου μυδιού σε παράκτιες ζώνες της Ελλάδας χρησιμοποιώντας τεχνικές αλληλούχησης τρίτης γενιάς. Ο σκοπός της έρευνας είναι να εξετάσει πως επηρεάζεται η υγεία του μυδιού από την παρουσία παθογόνων μικροοργανισμών, τόσο για τον ίδιο τον οργανισμό, όσο και για τον άνθρωπο - καταναλωτή.
Στο πρώτο μέρος της μελέτης πραγματοποιείται η βιβλιογραφική ανασκόπηση για τη βιολογία και την καλλιέργεια του είδους Mytilus galloprovincialis. Πιο συγκεκριμένα, αναφέρονται τα γενικά χαρακτηριστικά του μυδιού, οι τρόποι αναπαραγωγής και καλλιέργειας τους. Έπειτα, γίνεται αναφορά στο μικροβίωμα μυδιού, τη σύνθεση, την αλληλεπίδραση του με τον οργανισμό και τις επιδράσεις που δέχεται από το περιβάλλον. Ο Θερμαϊκός Κόλπος, ως σημαντική περιοχή μυδοκαλλιέργειας, αναλύεται τόσο από γεωμορφολογική όσο και από περιβαλλοντική άποψη, με έμφαση στη ρύπανση. Εν συνεχεία, παρουσιάζεται η εξέλιξη των τεχνικών αλληλούχησης του DNA, με έμφαση στις σύγχρονες μεθόδους ανάλυσης του μικροβιώματος, την αλληλουχία του 16S rRNA και τη χρήση της φορητής συσκευής MinION για ανάλυση DNA και RNA σε πραγματικό χρόνο.
Στο δεύτερο μέρος της εργασίας περιγράφονται αναλυτικά τα στάδια της δειγματοληψίας, η απομόνωση και η ποσοτική και ποιοτική αξιολόγηση του DNA, καθώς και η βιοπληροφορική ανάλυση των δεδομένων. Παράλληλα, γίνεται αναφορά στις τεχνικές ηλεκτροφόρησης και PCR, που χρησιμοποιήθηκαν για την ενίσχυση και την επιβεβαίωση των γενετικών δεδομένων. Στο τελευταίο μέρος αναλύονται τα αποτελέσματα που αποκαλύπτουν τη σύνθεση του μικροβιώματος των μυδιών και την επίδραση των περιβαλλοντικών συνθηκών στη διαμόρφωσή του. Παρουσιάζεται η ποικιλομορφία των μικροοργανισμών, η ταξινομική τους κατανομή και η παρουσία παθογόνων που μπορεί να επηρεάσει τόσο τα μύδια όσο και την ανθρώπινη υγεία.
Τα κύρια ευρήματα της έρευνας που προέκυψαν επιβεβαίωσαν την ύπαρξη παθογόνων μικροοργανισμών. Η παρούσα εργασία αναδεικνύει τη σημασία για περαιτέρω κατανόηση του μικροβιώματος των μυδιών και τη βελτίωση της μυδοκαλλιέργειας στην Ελλάδα.
Description
Keywords
Τεχνικές αλληλούχησης τρίτης γενιάς, Μύδια