Ο μεταγραφικός παράγοντας coup-TF και το γονιδιακό ρυθμιστικό δίκτυο στο νευρικό σύστημα του αχινού Paracentrotus lividus
| dc.contributor.advisor | Φλυτζάνης, Κωνσταντίνος | |
| dc.contributor.author | Γούβη, Γεωργία | |
| dc.contributor.committee | Καζάνης, Ηλίας | |
| dc.contributor.committee | Μίντζας, Αναστάσιος | |
| dc.contributor.other | Gouvi, Georgia | |
| dc.date.accessioned | 2017-02-10T06:56:18Z | |
| dc.date.available | 2017-02-10T06:56:18Z | |
| dc.date.copyright | 2016-07 | |
| dc.degree | Μεταπτυχιακή Εργασία | el |
| dc.description.abstract | Ο Coup TF (Nr2F1), αποτελεί ένα μέλος της υπέρ-οικογένειας των πυρηνικών υποδοχέων και χαρακτηρίζεται ως ορφανός υποδοχέας. Είναι απαραίτητος παράγοντας στην νευρογένεση του εμβρύου του αχινού, όπως και όλων των μεταζώων. Εκφράζεται στο στοματικό εξώδερμα [ventral ή oral ectoderm (OE)] του εμβρύου, το οποίο περιλαμβάνει δύο κύριες νευρογενείς περιοχές την βλεφαριδωτή ζώνη [ciliary band (CB)], και το πρόσθιο νευροεξώδερμα [anterior neural ectoderm (ANE)]. Χωροειδικά και χρονοειδικά πρότυπα έκφρασης των ρυθμιστικών γονιδίων απαιτούνται για την δημιουργία ενός ρυθμιστικού δικτύου, gene regulatory network (GRN). Στην παρούσα μελέτη διερευνάται το πρότυπο έκφρασης των γονιδίων του ANE και του στοματικού εξωδέρματος όπως Six3, Fez, Ets4, Not, Sip1, Foxq2 και Gsc στην πρώιμη εμβρυική ανάπτυξη, με την χρήση qPCR και in situ υβριδοποίησης (WMISH). Επιπροσθέτως μελετάται το πρότυπο έκφρασης του γονιδίου SynB που χρησιμοποιείται ως μάρτυρας νευρικών κυττάρων. Το υπάρχων υπόδειγμα ρυθμιστικού δικτύου για το στοματικό εξώδερμα του εμβρύου του αχινού, το οποίο εμπεριέχει τo λιγότερο μελετημένo GRN-υπoδίκτυο του ΑΝΕ, δεν περιλαμβάνει το γονίδιο Coup-TF. Στόχος μας είναι να αναγνωρίσουμε τις ρυθμιστικές αλληλεπιδράσεις μεταξύ του Coup-TF και τον προαναφερθέντων γονιδίων, ώστε να τοποθετηθεί ο Coup-TF μέσα στο υποδίκτυο του ANE του εμβρυικού GRN. Για το σκοπό αυτό, πραγματοποιήσαμε μια σειρά πειραμάτων με έμβρυα που είχαν ενεθεί με ειδικά αντινοηματικά ολιγονουκλεοτίδια (morpholino) έναντι του μεταγράφου του Coup-TF, τα οποία δίνουν σαν αποτέλεσμα ακραίο φαινότυπο και απώλεια του ενδογενούς Coup-TF mRNA μετά από WMISH. Επίσης, αυτός ο φαινότυπος ακολουθείται από την έλλειψη των σεροτονεργικών νευρώνων και την απαλοιφή ή εκτοπική έκφραση αρκετών σημαντικών γονιδίων στην νευρογένεση του ANE και της CB. Τέλος παρουσιάζεται ένα προσωρινό υποδίκτυο στο οποίο φαίνονται οι ειδικές αλληλεπιδράσεις μεταξύ του Coup-TF και άλλων ρυθμιστικών γονιδίων στο πρόσθιο νευροεξώδερμα. | el |
| dc.description.translatedabstract | Coup TF (Nr2F1), an orphan member of the nuclear receptor super family, is an essential factor in neurogenesis of all metazoans as well as sea urchin embryos. Coup-TF is expressed in the oral ectoderm (OE) of the embryo, which includes the two major neurogenic territories, the ciliary band (CB) and the anterior neural ectoderm (ANE). The temporal and spatial expression patterns of regulatory genes are required for building a gene regulatory network (GRN). In this study we analyzed the expression profile throughout early development of ANE and OE genes such as Six3, Fez, Ets4, Sip1, FoxQ2, Not, SynB and Gsc, by qPCR and whole mount in situ hybridization (WMISH). The current OE-GRN model for the sea urchin embryo, which includes the least studied GRN-subgroup of the anterior neural ectoderm, does not encompass Coup-TF. We aim to identify the regulatory interactions between Coup-TF and the aforementioned genes in order to place Coup-TF within the ANE sub-circuit of the embryonic GRN. Thus, we performed a series of experiments with specific anti-Coup-TF morpholino injected embryos that result in severe phenotype and loss of endogenous Coup-TF mRNA as judged by WMISH. Such repression of Coup-TF in developing sea urchin embryos, results in the absence of serotonergic neurons and diminishing or ectopic expression of a number of key neurogenic genes of the ANE and CB. A provisional GRN that indicates the specific interactions between Coup-TF and other neural ectoderm regulatory genes will be presented. | el |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10889/9968 | |
| dc.language.iso | gr | el |
| dc.rights | 0 | el |
| dc.subject | Νευρογένεση | el |
| dc.subject | Αχινός | el |
| dc.subject | Ρυθμιστικά δίκτυα | el |
| dc.subject | Βλεφαριδωτή ζώνη | el |
| dc.subject.alternative | Neurogenesis serotonergic | el |
| dc.subject.alternative | Six3 | el |
| dc.subject.alternative | Coup-TF | el |
| dc.subject.alternative | GRNs | el |
| dc.subject.alternative | Synaptotagmin | el |
| dc.subject.alternative | Fez | el |
| dc.subject.alternative | Ets4 | el |
| dc.subject.ddc | 593.95 | el |
| dc.title | Ο μεταγραφικός παράγοντας coup-TF και το γονιδιακό ρυθμιστικό δίκτυο στο νευρικό σύστημα του αχινού Paracentrotus lividus | el |
| dc.title.alternative | Coup-TF and the neurogenic gene regulatory network in sea urchin Paracentrotus lividus | el |
| dc.type | Thesis | el |